Simulación y Herramientas de análisis de imagen. Aplicación en biología celular

Abstract

RESUMEN: La endocitosis es un proceso por el cual la célula introduce moléculas, y lo hace englobándolas en una invaginación de la membrana citoplasmática, formando una vesícula que termina por desprenderse de la membrana para incorporarse al citoplasma. La endocitosis de receptores como consecuencia de la acción de compuestos químicos puede ser estudiada, como una respuesta biológica con implicaciones farmacológicas. Para este tipo de estudio se hace imprescindible el desarrollo de una herramienta que permita evaluar de forma cuantitativa la formación de vesículas o endosomas. Durante este trabajo presentaremos una herramienta virtual o simulador, que simula imágenes del proceso de endocitosis en célula viva y además dicho simulador nos servirá para comparar distintos métodos de análisis de imagen con el objetivo de seleccionar el mejor de todos ellos y aplicarlo a un algoritmo de cuantificación de endosomas ya implementado en [1].

ABSTRACT: Endocytosis is a process used by cells to introcue molecules. The cells includes the molecules in an invagination of the plasma membrane, forming a vesicle that eventually detaches from the membrane to enter the cytoplasm. Receptor endocytosis as a consequence of the action of chemical compounds can be studied as a biological response to pharmacological implications. For this type of study it is essential to develop a tool to assess quantitatively the formation of vesicles or endosomes. In this paper we present a virtual tool or simulator, which simulates images of endocytosis in living cells. we will use the simulator to compare different methods of image analysis in order to select the best one and apply it to the quantification algorithm of endosomes implemented in [1].