SWI/SNF es un complejo remodelador de la cromatina con un papel clave en la regulación de la expresión génica y la reparación de DNA. Ha demostrado estar alterado en un 25% del total de casos de cáncer y concretamente, en un 20% de los casos de cáncer de pulmón. Las mutaciones en este complejo están asociadas con un peor pronóstico de la enfermedad y una disminución de la supervivencia. Por tanto, el análisis exhaustivo de las rutas moleculares subyacentes a la enfermedad en las que el complejo esté implicado podrá tener efectos considerables en el tratamiento de los pacientes. En el presente estudio se trabaja con modelos celulares deficientes en ARID1A, ARID2 y SMARCA4, tres de las subunidades de SWI/SNF más frecuentemente mutadas en adenocarcinoma, el subtipo más prevalente cáncer de pulmón. En estos modelos, se realizan experimentos de restitución proteica introduciendo diferentes construcciones que contienen la secuencia codificante de cada una de las subunidades mencionadas. Además, se generan librerías de RNAseq a partir de clones tanto deficientes en ARID1A como con sobreexpresión de dicho gen, con el objetivo de identificar las dianas génicas de los complejos SWI/SNF en el contexto de cáncer de pulmón.
SWI/SNF is a chromatin remodeling complex with a key role in the regulation of gene expression and DNA repair process. It has been shown to be altered in 25% of all cancer cases, and specifically in 20% of lung cancer cases. Mutations in this complex are associated with a worse prognosis of the disease and a decreased survival. Therefore, the exhaustive analysis of the molecular pathways underlying the disease in which the complex is involved could have considerable effects on the treatment of patients. The present study works with cell models deficient in ARID1A, ARID2 and SMARCA4, three of the most frequently mutated SWI/SNF subunits in adenocarcinoma, which is the most prevalent subtype of lung cancer. In these models, protein restitution experiments are carried out by the introduction of different constructs containing the coding sequence of each of the three mentioned subunits. In addition, RNAseq libraries are generated from both ARID1A-deficient and ARID1A-overexpressing clones, with the aim of identifying gene targets of SWI/SNF complexes in the context of lung cancer
Excepto si se señala otra cosa, la licencia del ítem se describe como Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International
