Evaluación de métodos de detección moleculares del coronavirus SARS-CoV-2

Abstract

Los coronavirus pueden producir saltos-interespecies, como ocurrió con el SARS-CoV-2 emergiendo la COVID-19. Con una alta transmisibilidad, letalidad y susceptibilidad de la población avanzó rápidamente, obligando a tomar medidas sanitarias para contenerla. Los avances científicos permitieron una rápida secuenciación del agente viral, desarrollo de métodos de diagnóstico y una vacuna que revertieron esta situación, poniendo en relevancia la necesidad de contar con métodos de diagnóstico precisos y útiles en el punto de atención del paciente (POCT). En este trabajo analizamos la evolución de los métodos de diagnóstico del SARS-CoV-2 y como se integran con otras ciencias y tecnologías. Por un lado, validamos el uso de un termociclador portátil y un kit basado en PCR en el entorno sanitario, comparándolo con los test de antígenos comerciales y un método basado en amplificación isotérmica (RPA) propio. Comparamos estos métodos con utilidad POCT entre sí y con el método de referencia, demostrando la eficacia del método basado en PCR con respecto a los otros. Avances en este sentido permiten una mayor contención de agentes infecciosos presentes y adaptación a fenómenos infecciosos futuros.

Coronaviruses can lead to inter-species jumps, as occurred with SARS-CoV-2 emerging as COVID-19. With high transmissibility, lethality, and population susceptibility, it swiftly advanced, necessitating public health measures to contain it. Scientific advancements facilitated rapid viral agent sequencing, diagnostic method development, and vaccine production, reversing this situation, highlighting the necessity for precise and practical point-of-care diagnostic methods (POCT). In this study, we analyze the evolution of SARS-CoV-2 diagnostic methods and their integration with other sciences and technologies. On one hand, we validate the use of a portable thermocycler and a PCR-based kit in healthcare settings, comparing them with commercial antigen tests and our own method based on recombinase polymerase amplification (RPA). We compare these POCT methods with each other and with the reference method, demonstrating the efficacy of the PCR-based method over others. Advancements in this realm enable better containment of present infectious agents and adaptation to future infectious phenomena.