Evaluación del sistema MALDI-TOF VITEK MSTM para la identificación rápida de microorganismos de interés clínico

Abstract

RESUMEN: La identificación de los microorganismos ha sido una de las principales tareas del microbiólogo a través de los tiempos. La espectrometría de masas (EM) ha irrumpido con fuerza en los laboratorios, en principio, para la identificación de microorganismos. La motivación de la tesis fue demostrar que la espectrometría de masas MALDI-TOF es una técnica fiable, rápida y precisa que permite identificar a nivel de especie la mayor parte de los microorganismos presentes en muestras de origen humano clínicamente relevantes, de manera que puede utilizarse en la rutina diaria de un laboratorio de microbiología clínica como alternativa o complemento a las técnicas tradicionales. Para validar esta hipótesis se planteó el objetivo inicial de evaluar el sistema MALDI-TOF VITEK MSTM (bioMérieux, Marcy l'Etoile, Francia) en una colección de cepas que incluía una variedad de especies representativa de las aisladas con más frecuencia en nuestro laboratorio. A continuación, se evaluó la aplicación de la técnica para resolver la identificación a nivel de especie de 3 grupos de microorganismos: el complejo Acinetobacter baumannii (ACB), Rhodococcus equi / Dietzia spp. y Candida spp.. Finalmente concluir que la tecnología MALDI-TOF es una buena metodología para la actividad rutinaria en laboratorios de microbiología clínica, ya que identifica una amplia gama de especies bacterianas y levaduras de importancia clínica, con rapidez y precisión.

ABSTRACT: The identification of microorganisms has been one of the main tasks of the microbiologist over time. Mass spectrometry (MS) has entered laboratories strongly, in principle, for the identification of microorganisms. The aim of the thesis was to demonstrate that mass spectrometry MALDI-TOF is a reliable, fast and accurate technique that allows the identification at species level of most microorganisms present in clinically relevant human samples. so it can be used in the daily routine of a clinical microbiology laboratory as an alternative or complement to traditional techniques. To validate this hypothesis, the initial objective of evaluating the MALDI-TOF VITEK MSTM system (bioMérieux, Marcy l'Etoile, France) was set out in a collection of strains that included a variety of species representative of those most frequently isolated in our laboratory. The application of the technique to resolve the species-level identification of 3 groups of microorganisms was then evaluated: Acinetobacter baumannii complex (ACB), Rhodococcus equi/Dietzia spp. and Candida spp.. Finally, conclude that MALDI-TOF technology is a good methodology for routine activity in clinical microbiology laboratories, identifying a wide range of clinically important bacterial and yeast species, quickly and accurately.