Análisis de imagen y estereología aplicada a imágenes de microscopía de fluorescencia

Abstract

RESUMEN: El conteo del número de endosomas en imágenes de microscopía de fluorescencia sirve para cuantificar la acción de distintos fármacos y medir su efectividad. En este trabajo aplicamos muestreo geométrico y estereología para estimar de forma insesgada el número de endosomas visibles en dichas imágenes. En primer lugar describimos el método y demostramos la insesgadez del estimador. Además, describimos una fórmula para estimar la varianza del estimador. Después aplicamos los estimadores a simulaciones para verificar que se han implementado correctamente. Por último, aplicamos el método a dos imágenes reales con distintos fármacos: DAMGO y Morfina+Serotonina y comprobamos que cada fármaco genera un número de endosomas distinto.

ABSTRACT: The efficiency of different drugs can be quantified by counting the number of endosomes in fluorescence microscopy images. Here, we use geometrical sampling and stereology estimate the number of visible endosomes in such images. First, we describe the method and prove the unbiasedness of the estimator. Furthermore we describe a formula to estimate the variance of the estimator. The estimators are applied to several simulated images to verify that they have been correctly implemented. Lastly, we apply our method to real images with different drugs, namely DAMGO and Morphine+Serotonine, and check that they generate different amount of endosomes.